Perphyl é utilizado no tratamento da obstipação crónica habitual, no tratamento e prevenção da encefalopatia porto-sistémica e do pré-coma e coma hepático. É ainda utilizado em tratamento de enterites por salmonelas e situações como hemorróidas, fissura anal, fístulas, abcessos anais, úlceras solitárias e no pós-operatório ano-rectal.